Agent Skills
返回列表
PubMed 文献查阅器

PubMed 文献查阅器

知识管理 更新于 2026.08.30

将以下提示词粘贴到你的 AI 对话框中:

请根据 https://skillhub.cn/install/skillhub.md,安装 @user_0611a1f0/pubmed-literature-viewer-skill。

技能介绍

要解决什么问题

做医学或生命科学方向的调研时,你往往要在 PubMed 里翻检索式、核对 PMID、再手工整理标题、作者、期刊和摘要。本技能把这条链路收成固定工作流:用自然语言说明检索意图,通过 esearch + efetch 拉取记录,最后输出中文可读的 Markdown 报告,而不是裸 JSON 或英文摘要堆砌。

技能如何工作

  1. 构造检索式:把需求转成 PubMed 查询串;复杂场景(MeSH、字段限定、文献类型、日期范围)可参考技能内的 references/pubmed-query-syntax.md。常见约定包括:「最新」用 --sort pub_date 并视情况加 --mindate;「最相关」用默认 relevance;RCT / 系统综述等加 randomized controlled trial[pt] 等类型过滤;未指定篇数时默认 --retmax 5;直接给 PMID 则走 --pmids,跳过检索。
  2. 运行 scripts/pubmed_search.py:仅依赖 Python 标准库,向 stdout 输出 JSON(ok、query、count、pmids、articles[])。每篇含 pmid、title、authors、journal、pubdate、abstract、doi 及链接字段。不得凭记忆编造 PMID、标题或 DOI。
  3. 整理报告:按模板逐篇写标题(附中文翻译)、作者(超过 3 位列前三位加「等」)、期刊、日期、摘要中文概述、DOI / PubMed 链接;多篇时可加简短「整体趋势」小结。

边界与注意点

  • 需要能访问 eutils.ncbi.nlm.nih.gov;网络不通时应如实说明,不能虚构文献。
  • 无 API key 也可使用(约 3 次/秒限速);当输出含 api_key_hint: true(批量 ≥20 篇未带 key,或 HTTP 429)时,应按 register-api-key.md 用通俗话引导用户注册 NCBI key;key 仅作参数或环境变量 NCBI_API_KEY,勿写入文件或记忆。
  • count 为命中总数,articles 仅为前 retmax 篇;ok: false 时如实报告 error。

使用场景

  • 临床小组要更新某病种的用药证据,需在 PubMed 按 RCT 类型和近五年日期检索并整理成中文摘要供讨论。
  • 研究生写开题或综述章节,要把自然语言课题转成检索式,抓取系统综述或 Meta 分析并附 DOI、PubMed 链接。
  • 手头有一串 PMID,需批量 efetch 题名、作者、期刊、摘要,统一成 Markdown 条目而非手工复制网页。
  • 撰写患者教育或科普稿前,先按关键词查最新发表文献,用中文概述核对摘要内容是否支持表述。

适合人员

  • 在三甲医院轮转、常为病例讨论或科室会搜集近五年循证文献的住院医师
  • 撰写学位论文文献综述、需要 MeSH、文献类型与日期限定等规范检索式的生物医学研究生
  • 为药企、CRO 或学会整理临床试验与综述材料、要中英题名与摘要对照的医学写作与资料专员
  • 面向临床科室做文献检索培训的医院图书馆员,需把检索结果转成医生可读的中文结构化条目