PubMed 文献检索

问题

做医学文献综述时，PubMed 有 30M+ 条记录，但 PMC 全文只覆盖约 4M 条 OA 文章。仅依赖 PMC 抓取会漏掉大部分非 OA 文献；若逐篇查全文，又会卡在订阅墙和 ID 映射上。尤其当检索结果横跨多个年份、期刊和 MeSH 主题时，人工整理摘要与 OA 状态很容易出现遗漏。

工作方式

该技能把检索、摘要、OA 判断拆成稳定流程，把 NCBI E-utilities 的调用顺序固定下来，减少手工拼接 URL 和判断 ID 的成本：

• 使用 esearch 执行 PubMed 查询，支持 tiab、mesh、journal、dp、author 等完整语法；
• 用 esummary 取 pmcid，判断是否开放获取；
• 用 efetch 获取结构化摘要；
• 对存在 PMCID 的文章，通过 OAI-PMH 拉取全文 XML；
• 输出强制标注 [OA] 或 [非OA]，并给出 PMID、PMCID 与批量 OA 统计。

流程面向工程师：无 API key 也可运行，内置约 400ms 请求间隔以适配 3 req/s 限制。

边界

非 OA 文献只有摘要和元数据；高峰期大批量请求可能受限；1975 年前文章元数据可能不完整。若需要全文，应只依赖 [OA] 标记，或转向机构订阅、出版商与 DOI 获取。它更适合做文献清单、摘要对比和 OA 筛选，不适合替代正式引用校验、全文 OCR 或数据库授权合规。