单基因肿瘤文献锚定研究规划

要解决什么问题

常规肿瘤单基因生信论文往往遵循固定叙事链：锁定靶基因 → 肿瘤与正常表达对比 → 生存与临床病理关联 → 通路解读 → 免疫微环境 → 基因组/表观/蛋白层支撑，再视需要加入药敏或外部队列验证。难点不在于「列工具」，而在于在公开数据约束下把各分析模块的依赖关系写清楚，并避免预后、免疫或验证结论超出已有证据层。

本技能面向「已有候选基因、要做可发表设计」的场景，输出的是完整研究设计（含四档工作量与一条主推荐路径），而不是文献综述或工具清单。

技能如何工作

输入需包含 癌种、靶基因 与 验证/侧重点（可选：仅公开数据、免疫角度、甲基化/CNV、药敏、蛋白表达、偏好配置档位等）。执行流程大致为：

1. 推断研究类型：从输入中固定肿瘤背景、靶基因、主目标（表达优先/预后优先/免疫/基因组/转化验证）与资源约束。
2. 选择研究模式：在表达与差异语境、预后与临床关联、功能与免疫解读、基因组/表观/药物语境、多层公开/正交验证等模式间组合。
3. 输出四档配置：Lite / Standard / Advanced / Publication+，每档含目标、数据资源、主要模块、工作量与图表复杂度、优劣；默认主推荐多为 Standard。
4. 文献检索层：为主推荐方案检索可核验参考文献（含 DOI/PMID 等可解析标识），不编造引用；无法核验时明确证据缺口或检索策略。
5. 依赖一致性检查：预后、免疫、甲基化/CNV、蛋白/ROC 等声明必须与上游已声明的数据源与证据层一致；纯公开生信方案禁止实验验证或过度治疗性断言。
6. 完整设计输出：按固定章节（科学问题、配置表、主方案、依赖/证据图、逐步工作流、图表计划、验证层次、最小可执行版本、发表升级路径、文献包、自批判风险回顾）交付。

工作流中若提及数据集，会附带数据集仅为参考、需按课题与数据质量最终选型的免责声明。

适用边界与注意点

不在范围内的请求应被明确拒绝并说明原因，例如：临床治疗方案或个体化处方、无先验靶基因的全基因组发现、纯单细胞且无 bulk/门户骨架、纯湿实验机制且无生信整合、非生物医学话题。

适合触发示例：「HNSCC 单基因 SERPINE1 方案并要参考文献」「表达+预后+临床+甲基化+ROC 式支撑」「公开数据单基因肿瘤研究四档配置」等。