单细胞研究规划师

要解决什么问题

很多课题只有「疾病/表型 + 想用单细胞」的粗方向，却缺少可落地的研究设计：研究问题是否适合 scRNA、该用哪种研究模式、样本如何分组、公共数据能否支撑、分析模块该做到哪一步、验证与图表交付如何对齐审稿预期。本技能不是工具清单、文献综述或全文写作器，而是把方向收敛成结构化、可执行的单细胞研究方案。

技能如何工作

输入可以是疾病/表型、机制主题、细胞状态或生物标志物问题、组织微环境话题，或「只做公共数据」「无湿实验」等约束。执行流程固定为七步：

1. 推断研究意图（生物学/转化目标、发现 vs 验证 vs 延伸、资源约束）
2. 用 references/study-patterns.md 选定主导研究模式（必要时标注次要模式）
3. 输出 Lite / Standard / Advanced / Publication+ 四档工作量对比
4. 推荐一档主方案并说明为何上下档是「最低可执行」或「升级项」
5. 在提及数据集/队列前做依赖一致性检查；工作流前插入Dataset Disclaimer
6. 按模板生成逐步工作流，并匹配 analysis-modules / method-library 中的核心分析模块与具体方法
7. 设计验证证据层级、图表与交付物，并以风险自评收尾（最强环节、最易过解读、审稿人可能质疑、信号失败时的退路）

强制输出结构为 A–L 节（意图摘要、研究模式、四档配置、主推荐、数据策略、分析模块表、验证层、工作流、证据层级、图表计划、文献或检索策略、风险回顾）。引用层禁止编造 PMID/DOI 或 accession；数据集仅作候选方向并标注不确定性。

适用边界

• 适用：从方向到完整单细胞课题设计、数据集与分析路线建议、带验证梯度的可发表级工作流规划。
• 不适用：个体化诊疗建议、无单细胞成分的纯 bulk 组学、虚构数据集/文献、纯湿实验 SOP 且无研究设计成分——会按规范拒答并说明原因。