Adaptyv 蛋白质云实验平台
将以下提示词粘贴到你的 AI 对话框中:
请根据 https://skillhub.cn/install/skillhub.md,安装 @org-02qudk26/adaptyv-zh。
技能介绍
要解决什么问题
蛋白质设计或候选序列往往停留在计算预测阶段:溶解度、界面稳定性、表达量都需要湿实验验证,但自建 BLI、表达与热稳定性流程成本高、周期长。Adaptyv 把这类检测放到云端,用统一接口提交序列,由平台执行实验并在约 21 天内回传结果,适合把「算出来的序列」接到可重复的验证闭环里。
技能如何工作
技能围绕 Adaptyv 的认证、提交与结果跟踪组织说明,并指向更细的参考文档:
- 实验类型:结合实验(BLI 蛋白-靶点相互作用)、表达测试、热稳定性、酶活等;类型与工作流见
reference/experiments.md。 - 提交流程:通过 API 或 Web 界面提交蛋白质序列;完整端点与请求/响应格式见
reference/api_reference.md,常见用例(提交、状态、批处理)见reference/examples.md。 - 序列优化:提交前可先做溶解度与稳定性相关的预处理——例如未配对半胱氨酸、疏水聚集、溶解度差等问题;文档推荐 NetSolP/SoluProt、SolubleMPNN、ESM、ipTM、pSAE 等工具,工作流见
reference/protein_optimization.md。 - 访问方式:需向
support@adaptyvbio.com申请 API token,并用环境变量或.env配置凭证。
适用边界与注意点
平台处于 alpha/beta,功能可能变动,且并非所有 Web 能力都已暴露为 API。交付周期通常约三周,不适合需要当日反馈的探索性调试。更偏高通量、AI 驱动设计流水线;若你要做多步推理、长会话研究或与多工具编排,文档建议考虑 K-Dense Web 等托管环境,但简单「提交序列 → 等结果」仍可直接按本技能与 reference 使用。
使用场景
- 用 API 批量提交 AI 设计蛋白序列,走结合(BLI)、表达或热稳定性检测并轮询约 21 天的实验状态
- 在下单合成前,对候选序列做溶解度与疏水暴露筛查,再按 reference 工作流提交 Adaptyv 表达测试
- 把酶活或界面稳定性验证接到内部设计流水线里,用 examples 里的批处理模式统一取回结果
- 需要湿实验佐证计算评分时,通过 Web 或 API 提交序列,替代自建 BLI 与稳定性平台
适合人员
- 做抗体或 binder 设计的计算生物学家,要把 in silico 排序结果送到 BLI 结合实验验证
- 负责高通量蛋白变体库的研发科学家,需要表达量与热稳定性等统一外包检测而非自建湿实验线
- 维护 AI 蛋白质设计流水线的生物信息工程师,要把 Adaptyv 提交、状态查询与结果拉取写进自动化脚本
- 在 alpha/beta 阶段已拿到 API token 的团队,需要按 api_reference 对接认证与端点并管理长周期订单