腾讯 ORI 蛋白序列生成预测模型
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请根据 https://skillhub.cn/install/skillhub.md,安装 @tencent-adm/ori-collection-skill。
技能介绍
面向蛋白生成与预测的运行入口
在腾讯健康组学平台中,ORI Collection (Nextflow) 把蛋白质生成、信号肽预测、溶解度预测、热稳定性预测和结构预测拆成多个子应用。实际调用时容易踩坑:合集 AppId 不能直接作为 omics run 的 --public-app,Nextflow 子应用还需要确认 --nf-version,项目里已有同名应用会触发导入冲突,C 端体验用户还受剩余天数和今日次数限制。
核心能力与关键步骤
该技能把上述约束固化为可执行流程:
- 锁定范围:只服务
ORI Collection (Nextflow),内置 5 个子应用 AppId,避免运行时错误展开其他合集。 - 环境检查:先确认 CLI 可用,再通过
whoami与config show校验登录态、地域、项目、环境和存储桶配置。 - 子应用匹配:按名称、编号或功能描述匹配
Generate Protein、USMFold Predict、Solubility、Thermostability、Signal Peptide。 - 导入保护:运行前做同名检查,遇到冲突时引导重命名,而不是删除或覆盖项目已有应用。
- 提交控制:展示完整命令与参数摘要,二次确认后再执行;C 端用户在首次进入和每次
omics run前都会检查配额。 - 输入适配:需要本地生成的 FASTA 等文件时,先上传到绑定的 COS 桶,再作为运行参数传入。
- 故障定位:对
DUPLICATE_APP_NAME、MISSING_NF_VERSION、PARAM_MERGE_FAILED、鉴权失败等错误给出明确处置路径。
适用边界与注意点
它适合在组学平台跑 ORI 蛋白生成和预测任务,不适合调用其他公共应用或项目内应用;越界请求会被拒绝并引导使用更通用的任务技能。技能不会替你修改应用代码,也不会在未确认时提交任务;异步失败时更偏向取证和复跑,而不是自动改 pipeline。
使用场景
- 在组学平台提交 ORI 蛋白质生成任务,并让技能自动核对子应用 AppId 与 Nextflow 版本。
- 已有本地 FASTA 序列文件,要先上传到绑定 COS 桶,再作为 ORI 溶解度预测输入运行。
- 项目里已有同名应用导致导入冲突,需要技能停下来让我重命名,而不是覆盖或删旧应用。
- C 端体验用户提交热稳定性预测前,需要检查剩余体验天数和今日运行次数是否足够。
适合人员
- 在腾讯健康组学平台做蛋白生成实验的算法工程师,希望少手写 AppId 和配置检查。
- 需要把本地 FASTA 输入组学任务的研究员,想完成 COS 上传与运行参数对齐。
- 管理组学项目环境的平台管理员,想减少同名导入、缺 NF 版本和鉴权失败反复排障。
- 使用 C 端体验配额的生物计算用户,想在提交前确认剩余天数和今日次数。