腾讯IgGM·Protenix抗体设计流程
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请根据 https://skillhub.cn/install/skillhub.md 安装 @tencent-adm/iggm-protenix-no-msa-wdl。
技能介绍
抗体研发流程的工具化痛点
抗体研发中,从候选分子生成到结构预测往往分散在多个工具里。手动拼接命令时,参数容易出错;不同工具的运行环境、权限和命名规范也不一致,导致流程难以稳定复现。
技能的核心能力
该技能严格锁定 抗体研发-IgGM-Protenix-免MSA版-WDL 这一公共应用,统一通过 scripts/omics_cli.py 拼接命令。核心步骤包括:鉴权与配置检查(C端用户需执行配额首检)、导入前同名检查(必须带 --type WDL)、二次参数确认、运行前配额检查,最后执行 omics run。输入参数支持默认填充或通过 --input 覆盖,本地生成的序列文件需先上传至 COS 后再传入。
适用边界与注意点
- 仅能运行指定应用,无法执行其他应用或项目内已有应用。
- C端用户必须通过配额首检和运行前配额检查,阻断情况不进入业务流程。
- 运行含
outdir参数时,任务完成后需主动提醒用户查看输出目录。 - 同名冲突时必须引导用户重命名,不得自动生成名称或修改已有应用。
使用场景
- C端用户在运行抗体设计应用前,需检查体验配额和鉴权配置,避免运行中断。
- 用户导入抗体设计公共应用时,需确认项目内无同名应用,防止运行失败。
- 使用AI生成的蛋白质序列作为输入时,需先上传到COS桶再运行流程。
- 抗体设计流程运行完成后,用户需查看输出目录中的结构预测结果文件。
适合人员
- 生信工程师,需要快速生成抗体候选分子并进行免MSA的结构预测。
- 生物医药研究员,想要验证IgGM和Protenix流程在抗体研发中的具体应用。
- 腾讯健康组学平台的体验用户,需要通过技能调用公共抗体设计应用。
- AI辅助药物研发工程师,需要将本地生成的蛋白质序列上传到COS后运行结构预测。