科研助手
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请在 AI 助手中根据 https://skillhub.cn/install/skillhub.md,安装 @zcwl/scientific-research-assistant。
技能介绍
解决的问题
科研流程中,文献、数据、代码和稿件往往分散在不同工具里:检索用数据库,统计用 Python,图表用绘图库,论文引用靠手动整理,药物发现还要查询化合物库和对接工具。科研助手 的目标是把这条链路接到支持 SKILL.md 与 exec 的 Agent 中,让研究者用自然语言或结构化参数发起任务,并在 output/ 目录得到可检查的中间产物。
核心能力与关键步骤
- 文献综述:围绕主题检索
PubMed、Google Scholar、arXiv,做前向/后向引用追踪、纳入排除、偏倚风险和质量评估,生成背景、方法、结果、讨论结构,并处理APA、Nature、IEEE等引用格式。 - 数据分析与可视化:覆盖描述统计、
t 检验、ANOVA、回归、PCA、聚类、Kaplan-Meier和Cox;生物信息学侧可调用BLAST、Scanpy、KEGG等流程,输出热图、火山图、UMAP、t-SNE等图形。 - 药物发现:从靶点识别到虚拟筛选,再到
SAR优化,涉及Open Targets、ChEMBL、PubChem、ZINC、AutoDock、RDKit等工具链。 - 论文与基金:按
IMRaD组织稿件,准备摘要、图表说明、Cover Letter、期刊格式;基金侧输出假设、研究计划、预算规划和影响陈述。
适用边界
该技能适合工程化和半自动化科研辅助,不替代科学判断、同行评审、伦理审查、临床诊断或实验操作。涉及重计算、外部数据库或云 GPU 时,需要检查网络、依赖版本、随机种子、API 速率和密钥环境变量配置,避免硬编码敏感凭证。
使用场景
- 围绕研究主题检索PubMed、arXiv文献,整理引用关系并生成系统性综述框架。
- 对单细胞RNA-seq数据做质控、降维、聚类与差异表达,输出UMAP和火山图。
- 将实验数据整理为IMRaD初稿,补充结构化摘要、图表说明和参考文献格式。
- 基于文献空白提出可验证假设,生成研究目标、方法时间线和预算草案。
适合人员
- 生物医学研究员:需要把单细胞RNA-seq结果整理成可复现分析流程和图表。
- 博士生:需要围绕课题检索文献、追踪引用并起草IMRaD论文初稿。
- 药物研发工程师:需要查询靶点、化合物库并生成虚拟筛选与SAR分析记录。
- 科研基金申请人:需要把研究空白转成假设、研究计划、预算和影响陈述。