腾讯 CD-GPT 生成式生物基础模型
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请根据 https://skillhub.cn/install/skillhub.md,安装 @tencent-adm/cdgpt-collection-skill。
技能介绍
解决的问题
当工程师要在腾讯健康组学平台上运行 CD-GPT Collection (Nextflow) 时,常见麻烦不是模型能力,而是命令边界、鉴权配置和名称冲突:合集 AppId 不能直接 omics run,子应用 AppId 需要准确,C 端体验配额可能阻断,项目已有同名应用会导致 DUPLICATE_APP_NAME,本地生成文件还需要先上传到 COS。这个技能把上述约束收敛成一条固定流程,避免越权调用或参数拼错。
技能如何工作
该技能只服务 CD-GPT Collection (Nextflow) 两个 Nextflow 子应用:正向翻译生成 与 逆向翻译生成。核心步骤包括:
- CLI 与鉴权检查:确认
omics可用,执行whoami与config show,必要时引导omics login或配置Region / ProjectId / EnvironmentId / CosBucketName。 - 子应用匹配:从硬编码清单中选择
CD-GPT_translation_generation或CD-GPT_reverse_translation_generation,不使用合集 AppId。 - 运行前确认:检查同名应用、确认
--public-app-name、--nf-version、--input,C 端用户还会做配额检查。 - 执行与排障:调用
omics run,遇到孤儿应用、缺失 NF 版本、参数合并失败或鉴权失败时给出对应处理建议;若输出包含outdir,完成后提醒查看结果目录。
适用边界
该技能面向 CD-GPT 生物序列翻译/生成类任务,尤其是 DNA、RNA、蛋白质序列相关的正向与逆向翻译流程。它不替代通用组学任务技能,不能运行本合集以外的应用;涉及本地文件输入时,需要用户指定 COS 路径并确认上传。
使用场景
- 在组学平台中运行 CD-GPT 正向翻译生成子应用,并完成鉴权、参数确认与任务提交。
- 需要把 AI 生成的蛋白质序列文件先上传到 COS,再作为输入运行逆向翻译生成任务。
- 排查 `omics run` 返回同名应用、缺失 NF 版本或鉴权失败时的处理路径。
- 任务完成后根据 `outdir` 提醒确认 DNA、RNA 或蛋白质序列结果文件位置。
适合人员
- 需要调用组学平台 CLI 的 Bioinformatics 工程师
- 要复现蛋白质序列生成流程的计算生物学研究人员
- 维护 Nextflow 应用参数与运行环境的平台工程师
- 负责 AI 生成序列文件上传和任务排障的应用开发者