化学合成路线辅助
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技能介绍
解决什么痛点
在制剂研发与注册岗位上,经常需要评估合成路线,但非合成背景的工程师往往面临几个具体问题:看不懂复杂的逆合成逻辑、难以从文献和专利中提取可比对的路线数据、对保护基和反应条件的兼容性缺乏把握,更重要的是,容易忽略放大生产中的安全红线。这个技能旨在提供一个结构化的推理抓手,帮助研发和注册人员“查得到、拆得开、比得清、用得安全”,而不是替代专业化学家的判断。
核心能力与工作流
技能通过路由机制调用不同的能力模块,并依赖本地知识库 data/registry.json 进行状态管理:
- 逆合成拆解与路线比对:将目标分子逐层拆解至可购起始原料,识别关键键与官能团;从论文或专利中提取步数、最长线性序列(LLS)、收率等字段,生成结构化的路线对比表。
- 反应与保护基建议:根据底物和官能团特征,按
references/reactions_pg.md给出首选与备选方案,并明确标注“温和/剧烈”及兼容性(如TBS对碱敏感)。 - 安全风险提示:在给出路线前,主动扫描高危试剂(如叠氮、重氮盐、高压氢化),触发强制的“⚠️ 安全红线”段落。
- 自我成长与合规联动:每次查询时,先运行
scripts/registry_cli.py query检查知识库新鲜度。若条目过期或缺失,则通过文献检索核实,并用scripts/registry_cli.py add写回,实现知识库的逐条累积。涉及专利或法规时,联动regulatory-monitor复核 IP 与注册基线。
适用边界与注意
本技能不臆造反应。对于不确定的试剂或条件,会明确标注“待实验验证”并提供文献检索建议。输出统一采用“树状+表格”格式,结构式优先用 SMILES 或 IUPAC 名称表述。需要注意的是,当离线基线 references/regulatory_baseline.md 超过 6 个月时,涉及工艺合规和专利 FTO 的问题必须先触发合规复核,不能直接依赖旧版基线作答。
使用场景
- 拿到一个新药候选分子的结构式,需要快速拆出 2–3 条逆合成线,标出关键 disconnection 与可用试剂,判断哪条更短或立体控制更好。
- 整理多条来自论文和专利的合成路线,要按步数、最长线性序列、总收率、高危试剂等字段做结构化对比表,供放大或立项决策。
- 底物含羟基和氨基需要选择性保护,要得到首选加备选的保护基方案,并确认与后续偶联步骤的兼容性。
- 路线中出现了叠氮或高压氢化步骤,需要在输出前主动标注安全红线,给出替代条件或工程控制建议。
适合人员
- 制剂研发工程师,合成背景较弱,需要把目标分子拆成可购起始原料并判断路线可行性。
- 药品注册专员,需要从文献和专利中提取路线信息,整理成符合申报要求的结构化材料。
- 工艺放大工程师,关注路线的步数经济性、总收率以及放大时的安全风险。
- 项目立项人员,需要在早期评估候选路线的专利风险和规避空间。