跨疾病共享生物标志物网络规划

要解决什么问题

跨疾病比较生信论文往往被写成「工具清单」或文献综述：两种病各做一遍 DEG，再罗列 GO/KEGG、PPI、TCGA 验证，却缺少可执行的研究设计——步骤之间的证据依赖、工作量档位、以及「公共库-only」与湿实验声称之间的边界常常对不上。本技能面向典型文章骨架：多病数据集选型 → 分病 DEG → 重叠/共享 DEG → 富集 → PPI 与 hub 基因 → GEPIA/HPA/TCGA 类验证 → TF-miRNA 共调控 → 免疫浸润 → DGIdb 类候选药筛选 → 可选 qRT-PCR/细胞验证，把模式抽象成可复用的跨病共享生物标志物研究框架，而不是机械套用某篇锚定文献。

技能如何工作

输入需包含 [疾病 A] + [疾病 B] + 共享标志物/机制/验证方向；可补充仅公共数据、免疫或药靶角度、TF/miRNA 网络、实验验证范围等。执行按固定七步推进：

1. 推断研究类型：病对关系、主目标（共享 DEG / hub prioritization / 网络解释 / 免疫或药靶 / 验证导向）、资源约束与验证野心。
2. 选择研究模式：共享 DEG 发现、hub prioritization、调控网络解释、免疫与药物跟进、生信+实验验证等模式可组合。
3. 输出四档配置（Lite / Standard / Advanced / Publication+）：每档含目标、数据资源、主要模块、工作量、图表复杂度、优劣势；默认推荐 Standard 为主路径。
4. 文献检索层：为推荐方案检索可核验的设计支撑文献（DOI/PMID 等），不编造引用。
5. 依赖一致性检查：例如 hub 基因须建立在 overlap + PPI 之上；未声明 TCGA/HPA/qPCR 时不得写蛋白或细胞表型级验证声称。
6. 逐步工作流：每步按模板说明逻辑与决策，而非只列工具名。
7. 强制输出 A–I 节：科学问题、四档对比表、推荐方案、依赖/证据图、完整流程（含数据集免责声明）、图表交付、分层验证说明、最小可执行版（约 2–4 周）、发表升级路径、参考文献包。

适用边界

不适用：临床用药建议、患者个体诊断、纯单病预后模型（无跨病比较）、纯 ceRNA 且无共享 DEG/hub 骨架、无生信整合的纯湿实验机制研究、非生物医学话题。超出范围时会明确重定向说明，并停止按本框架展开。