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孟德尔随机化方案设计器

孟德尔随机化方案设计器

行业专业 更新于 2026.08.29

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请根据 https://skillhub.cn/install/skillhub.md,安装 @user_c7479c7a/mendelian-randomization-protocol-designer。

技能介绍

要解决什么问题

孟德尔随机化(MR)用遗传变异作工具变量,在 GWAS 汇总统计层面做因果推断。实际开题时,暴露/结局怎么框、该两样本 MR 还是双向/MVMR/共定位延伸、IV 稀疏时怎么降级主张,往往比「跑哪个 R 包」更早卡住。本技能面向研究设计规划,输出可执行的协议框架,而不是文献综述、工具清单或普通观察性关联分析。

技能如何工作

输入通常是 暴露(或暴露族)+ 结局(或结局族),可附带人群祖源、仅公开数据、双向检验、中介/共定位/MVMR 等偏好。技能按固定八步执行:推断因果问题 → 从参考库选最佳研究模式 → 定义 GWAS 数据架构与祖源/重叠风险 → 设计 IV 筛选、LD clumping、弱工具与稀疏 IV 回退 → 选定主估计量(默认 IVW)与敏感性模块 → 仅在问题支持时加入扩展模块 → 定义证据层级与主张边界 → 输出 Lite / Standard / Advanced / Publication+ 四档工作量并推荐主路径。

交付物按 A–L 结构组织:研究框定、工作量表、推荐方案与模式、逐步工作流、数据与 IV 计划、核心分析模块及理由、验证策略、偏倚与失效点、可声明/不可声明的结论、图表交付、文献检索计划、最小可执行版本与升级路径。各节需对照 references/ 下的 workload、study-patterns、method-library 等模块生成,缺一则视为不完整。

适用边界

范围内:基于 GWAS 汇总统计的 MR 方案设计(因果筛查、机制优先、转化解读等不同主张强度需区分)。范围外:个体诊疗/用药建议、无 IV 设计的纯队列病例对照、PRS 部署与个体预测、无 GWAS 骨干的纯湿实验、非生物医学话题——会按模板说明并停止。未核实的数据集只标为候选来源类型,不编造 PMID、样本量或队列名称。

使用场景

  • 开题或预分析前,已确定暴露与结局(如 LDL 与阿尔茨海默病),需要完整两样本 MR 协议而非方法综述
  • 仅能使用公开 GWAS 汇总数据时,要为免疫相关表型与肺癌风险列出标准版与进阶版分析模块
  • 暴露链涉及多个相关因素(如吸烟、CRP 与类风湿关节炎),需判断多变量 MR 是否成立及首轮应排除的扩展
  • 投稿前需将某一暴露—结局 MR 问题补全为 Publication+ 档:图表交付、文献检索与主张边界

适合人员

  • 遗传流行病学方向的博士生或博士后,撰写开题/基金时需 A–L 结构化 MR 协议与 Lite 至 Publication+ 工作量表
  • 为临床或公卫课题组做 MR 方法支持的生物统计师,需 IV 阈值、clumping、IVW 与敏感性组合及稀疏 IV 时的主张降级规则
  • 将「循环细胞因子→冠心病」类问题转化为可发表 MR 设计的分子流行病学或心血管研究者
  • 负责稿件或内部方法学质控的审稿人/合作者,需核对因果措辞是否允许、双向 MR 或共定位是否被输入与数据架构支持