arXiv 论文检索
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技能介绍
要解决什么问题
做计算生物学、生物信息或 ML 落地时,你经常需要期刊尚未收录的预印本:方法论文在 cs.LG / stat.ML,系统生物学在 q-bio,PubMed 往往滞后或覆盖不全。手动在 arXiv 网页上翻页、复制摘要,既慢也不利于在对话里做文献梳理。
本技能把检索收敛成一条可重复的命令行流程:用自然语言式的 query 调 arXiv API,直接拿回结构化结果,而不是让你自己拼 HTTP 请求或解析 Atom feed。
技能如何工作
技能目录里提供 Python 搜索脚本(需本机安装 arxiv 包;未安装时会明确报错)。调用方式核心是:
query(必填):检索串,例如neural networks protein structure、single cell RNA-seq--max-papers(可选):返回条数上限,默认 10
脚本按与查询的相关性排序,逐篇输出 Title 与 Summary(摘要),篇与篇之间空行分隔,便于复制进笔记或继续追问模型。无需 API Key,面向 arXiv 的公开接口。
适用边界与注意
- arXiv 强项在计算机、统计、定量生物等计算/理论向工作;临床指南、纯实验湿实验文献仍以 PubMed 等库为主。
- 结果是预印本,未必经同行评议;引用前请核对是否已有正式发表版本。
- 结果集可包含较早上传论文,若你只关心「最近一月」,需在 query 或后续筛选里自行约束语义。
使用场景
- 开题或写基金前,PubMed 尚未收录,需要按关键词批量拉取蛋白质结构、神经网络等方向的 arXiv 预印本标题与摘要。
- 搭建单细胞 RNA-seq 或空间组学流程时,要对照 arXiv 上最新的计算方法论文,避免漏掉刚上传的预印本。
- 撰写系统生物学或定量生物方向综述,希望用固定 query 获取 q-bio 相关结果并按相关性排序阅读。
- 课题涉及统计学习在组学数据上的应用,需要从 arXiv 检索 stat.ML/cs.LG 论文,且条数可用 `--max-papers` 控制。
适合人员
- 计算生物学或生物信息方向的博士生/博士后,经常在 agent 对话里查预印本,而不仅依赖 PubMed。
- 负责组学分析流水线研发的生物信息工程师,为新模块查找 cs.LG、q-bio 上的方法文献并整理摘要。
- 撰写机器学习与生命科学交叉课程报告的学生,需要脚本输出 Title/Summary 便于粘贴进笔记或大纲。
- 协助 PI 做文献调研的科研助理,要在期刊正式发表前汇总某主题的 arXiv 相关论文。